Завод "ПРОТОН" организован в 2004 году на базе Экспериментального завода «Протон» Московского института электронной техники, который начиная с 1978 - 1982 годов прочно утвердился, как один из лучших производственных коллективов Министерства образования СССР.

В настоящее время Завод "ПРОТОН" представляет современное, высокотехнологичное производство, оснащённое высоко автоматизированным технологическим оборудованием и поточными линиями.
Основным направлением деятельности Завода "ПРОТОН", как и в прошлые годы, остаётся изготовление вычислительной техники, электронных узлов и блоков как для гражданского назначения, так и в интересах Министерства обороны РФ.
Размещение МИЭТ(ТУ) и завода «Протон» в г. Зеленограде – центре Российской микроэлектроники, создает дополнительные возможности для создания самой совершенной микроэлектронной аппаратуры, средств вычислительной техники и систем управления, что уже давно привлекло внимание разработчиков В и ВТ к творческим коллективам научно-исследовательской части (НИЧ) МИЭТ(ТУ).

Основными видами продукции завода являются:

- специальные вычислители;

- учебно-лабораторное оборудование и технические средства обучения для оснащения лабораторий вузов.

Работая на протяжении последних лет над совершенствованием системы качества, завод провел комплекс мероприятий, который существенно повысил эффективность деятельности всех подразделений завода. Достойным итогом этой работы было получение  «Сертификата соответствия»  системы менеджмента качества Завод "ПРОТОН" требованиям ГОСТ Р ИСО 9001-2001 и ГОСТ РВ 15.002-2003. . В настоящее время завод подтвердил соответствие СМК требованиям ГОСТ Р ИСО 9001-2008.

Испытательная станция завода располагает оборудованием и кадрами, необходимыми для проведения полного спектра климатических и механических испытаний, и имеет «Свидетельство об аттестации» выданное 22 ЦНИИ МО РФ.

Производственно-техническая деятельность Завод "ПРОТОН" в сфере разработки и производства современной электронной аппаратуры регламентируется:   Лицензией на осуществление разработки вооружения и военной техники и Лицензией на осуществление производства вооружения и военной техники, выданными Федеральной службой по оборонному заказу.

Производственные процессы и качество всей выпускаемой продукции контролируются сотрудниками Отдела Технического Контроля, а соответствие требованиям продукции, идущей по Государственному Заказу, дополнительно проверяется работниками Военного Представительства Министерства Обороны РФ.

Производство завода размещено на 6000 кв.м производственных площадей и включает 3 основных цеха, 1 вспомогательный цех и участок.

На заводе сформировался квалифицированный коллектив рабочих и ИТР, способный решать задачи высокой сложности, создан уникальный производственно-технологический комплекс, позволяющий изготавливать как экспериментальные, так и опытные образцы, и малые серии изделий вычислительной, радиотехнической, микроэлектронной и машиностроительной техники;
Так же, завод обладает, парком универсального механообрабатывающего, прессового, сварочного оборудования для изготовления деталей и их сборки. Имеет цеха для производства печатных плат, участки поверхностного монтажа, цех по производству микроэлектронной и радиоэлектронной аппаратуры. Участки гальванических и лакокрасочных покрытий, энергомеханический участок и столярный цех. Завод располагает оборудованием и кадрами, необходимыми для проведения полного цикла испытаний и конструктивно-технологической отработки изделий. Возможность изготовление изделий с приемкой «5»;