Биотуалет состоит из двух соединенных между собой баков: верхнего бачка для чистой воды и нижнего бака для стоков. Чистая вода из наполняемого бачка, который вместе с унитазом образует верхнюю двухкомплектную часть туалета, смывает отходы в расположенный внизу герметичный приемный резервуар, где они подвергаются дезодорации и химической обработке. Нижняя часть отсоединяется от основной конструкции, после чего ее можно легко доставить к месту выброса отходов и аккуратно слить содержимое.